Поиску могилы полководца способствовали визиты в Суздаль сыновей царя Николая I – цесаревича Александра Николаевича в 1837 году и Великих князей Михаила и Николая в 1850 году. Во время посещения Спасо-Евфимиева монастыря последним и показали место, где по преданиям прежде стояла усыпальница Пожарских. В Суздаль по поручению министра внутренних дел был командирован граф А.С.Уваров, известный ученый-археолог и общественный деятель, с особым поручением – найти могилу Дмитрия Михайловича Пожарского. Возле алтаря Спасо-Преораженского собора не было никаких признаков кладбища или какого-либо сооружения, но стоило копнуть в этом месте, как экспедиция графа наткнулась на фундамент какой-то стены. Это было основание усыпальницы, в которой в три ряда стояли кирпичные склепы и каменные гробницы. Одна из них выделялась своим внешним видом, имела кирпичный свод. Чтобы избежать ошибки в вопросе идентификации останков князя, с разрешения императора и Синода была назначена особая комиссия.
Двадцать третьего февраля 1852 года члены комиссии провели тщательный осмотр усыпальницы и гробницы. Тело усопшего покрыто саваном из шелковой материи с остатком богатых боярских украшений, золотым шитьем по кафтану и поясу, какие не мог иметь ни один из представителей рода Пожарских, кроме Дмитрия Михайловича. Только он носил титул боярина, полученный от царя Михаила Федоровича Романова за освобождение Москвы. «Нет никакого повода, тем менее права, сомневаться, чтобы гробница не заключала в себе праха князя Дмитрия Михайловича Пожарского».